Mision Cristiana Maranatha fue fundada originalmente por Mision Elim en Guatemala. Viendo la necesidad, Pastores Jose Alberto y Nardy Duran fueron enviados a San Salvador y fundaron varias iglesias en San Salvador y Santa Ana. En 1991, ellos se movieron a San Antonio, TX donde sirvieron como pastores asociados hasta 1997.

El Señor los llamo a abrir una iglesia en Austin, TX. Desde donde han desarrollado su ministerio. Al principio no era fácil, tenían que viajar de San Antonio a Austin para los días de servicios. No fue hasta finales de los 90's que se movieron a Austin donde oficialmente fundaron a Maranatha Austin.  

Los primeros servicios eran en el cuarto de la sala y garage y ha crecido hasta llegar a tener dos servicios de 800 personas en el día Domingo.